川上 潔 (理学博士 1983年 京都大学)
自治医科大学分子病態治療研究センター細胞生物研究部教授
京都大学理学部卒業
京都大学大学院理学研究科博士課程修了
◎研究活動
ヒトの体は一つの受精卵からはじまり、時間的空間的に厳密に制御されたシグナル分子や転写因子のネットワークによって、数多くの異なる機能を備えた細胞集団からなる個体になる。多くの難治性疾患は遺伝子機能の異常や発現の異常によっておこるが、発生過程にかかわる遺伝子異常による疾病も数多くみられる。私達はNa,K-ATPase遺伝子の転写調節因子を解析する過程で新たな遺伝子ファミリーSixを同定し、その転写制御機構や生体機能の解明をめざしている。Sixの協同作用因子であるEyaやDachとの相互作用の様式、Sixタンパク質が制御する標的遺伝子群の解析、Six遺伝子欠損マウスの表現型の解析を柱に研究を進めている。
(1)Six遺伝子群の構造と機能および転写制御機構
Six遺伝子群はショウジョウバエの眼の発生に必須なsine oculis(so)遺伝子と顕著な相同性がある新規ホメオボックス遺伝子群である。種々の生物種で同定されたSix遺伝子群はその相同性から3つのサブグループに分けられる(図1)。

図1
Six遺伝子産物と協同して働く遺伝子として、Eya遺伝子群が知られている。1997年BOR症候群の原因遺伝子の一つとしてEYA1が同定された。EYAのショウジョウバエホモログであるeyaはsoと相互作用し、複眼の形成を協調的に促進する。また、eyless、dacなどeyaとsoの上流や下流に位置する遺伝子が複雑な制御ネットワークを形成して複眼の形態形成を司っている。ニワトリの筋肉においてもPax3-Six1-Eya2-Dach2による遺伝子ネットワークが筋分化を司ることが示された(図2)。

図2
Six1/2およびSix4/5のサブグループはEyaとの協同作用がみられる。Eyaの核移行とSix-Eya複合体形成によってSixの標的遺伝子が活性化される(図3)。また、EyaとDachとの間の協同作用にはCBPが関与し、DachがDNA結合活性を有することが最近明らかになった。(図4)

図3 (Eya3は細胞質に分布する) (Six5-Eya3複合体は核に移行する)

図4
(2)Sixタンパク質の標的遺伝子の検索
Six5は筋緊張性ジストロフィー(DM1)の原因となるCTGリピート下流に存在するDMAHP遺伝子と同一である。DM1の原因のひとつはCTGリピートによるDMAHP/Six5の発現低下であると考えられている。その病態にかかわる分子機構解明を解明するためにSix5タンパク質によって制御される標的遺伝子の同定を行った。VP16-融合Six5およびVP16-融合Six5W241R(特異的DNA結合能を失ったSixタンパク質)を発現するアデノウイルスを構築し(図5)、P19胚性ガン細胞に感染した結果、VP16-融合Six5で特異的に誘導され、VP16-融合Six5W241Rでは誘導されない遺伝子群をマイクロアレーで同定した(表1)。
Six1およびSix4は感覚器、脳神経節、骨格筋、腎臓などの器官形成に必須であることが遺伝子欠損マウスの解析から明らかになってきた。腎臓形成におけるSix1およびSix4の標的遺伝子を後腎間葉由来mK4細胞を用いてスクリーニングした結果、表2に示す遺伝子同定された。発生過程で細胞増殖や分化に関わる遺伝子のみならず、イオンチャンネルなど腎臓の最終分化を特徴づける遺伝子群もSix1やSix4の標的となっていることが明らかとなった。
Six1/Six4二重欠損マウス胚において、Slc12a2、FigfおよびCol2a1の発現低下が観察され、生体内でも標的遺伝子となっていることが確認された。
(3)Six1遺伝子とパターン形成
私たちはSix1遺伝子欠損マウスを作成、解析することにより、耳、鼻、腎臓、胸腺、骨格筋等の多くの器官構築が影響を受けることを見いだした。内耳においては耳胞の形成は外見上正常にみえるが、出生時には蝸牛、前庭、半規管など、内耳の多くの構造が生じない(図6)。器官形成におけるSix1の役割を解明するために、耳胞における部域化に関連した遺伝子の発現を精査した(図7−9)。野生型耳胞の腹側部分を中心に発現するOtx1、Otx2、Lfng、Fgf3、Bmp4などの発現はSix1欠損マウスで消失(図7)。これに対し、野生型耳胞の背側を中心に発現するDlx5、Hmx3、Dach1、Dach2の発現領域は腹側に広がった(図8)。一方Six-Eya-Dach遺伝子ネットワークを形成する遺伝子群Pax2、Eya1、Six4などの発現には変化がなかった(図9)。これらの結果はSix1が耳胞の領域化を特徴づける複数の遺伝子群の発現調節に関わり、耳胞でのパターン形成に重要な働きをしていることを示す(図10)。

図6 内耳の形態変化

図7 耳胞腹側マーカー遺伝子の発現抑制

図8 耳胞背側マーカーの発現領域拡大

図9 Pax-Eya-Six遺伝子の発現

図10 Six1と耳胞パターン形成
(4)Six1遺伝子と細胞分化
嗅上皮では、嗅細胞(神経)、支持細胞、基底細胞、腺細胞など多様な細胞が分化し、整然とした上皮構造を形成する。Six1欠損マウスでは鼻の形成が異常になる。嗅細胞としての分化や嗅球への投射はなくなり、上皮構造が大きく崩れてくる。Six1が細胞分化や上皮構造の維持にどのように関わっているかを明らかにしつつある。
(5)ナトリウムポンプ遺伝子の生理機能
ナトリウムポンプは細胞内のナトリウムイオンを放出し、カリウムイオンを取り込む能動輸送ポンプである。触媒サブユニットであるαには4種のアイソフォームが存在し、発現部位が異なる。骨格筋、心筋及び脳に特異的に発現するalpha 2サブユニット遺伝子を欠損するマウスを作成したところ、次のような表現型を得た。
1. ホモマウスは生直後に動くことができず、呼吸不全で死亡する。
2. 出生直前(E18.5)では、扁桃体および梨状野で神経細胞の縮退がみられる。
3. 神経細胞の縮退はc-fosの発現増強から、神経の過興奮の結果と考えられる。
4. 脳内神経伝達物質の含量(グルタミン酸、GABA、セロトニン)が増加する。
5. グルタミン酸、GABAの神経細胞への取り込みが低下する。
6. ヘテロマウスにおいては、恐怖・不安行動の昂進が見られる。
7. へテロマウスは生後5-6ヶ月以降過食による肥満を示す。
これらの観察からナトリウムポンプalpha 2サブユニットは神経伝達物質のトランスポーターによる再吸収過程に関与し、遺伝子欠損の結果神経興奮が生じ、神経細胞死がおこされたと考えられた。扁桃体の異常はヘテロマウスでは、組織学的には確認されなかったが、恐怖・不安行動の昂進が観察されたことから、機能的な異常がおきていることが示唆された。

図11 ナトリウムポンプalpha 2サブユニット遺伝子欠損ホモマウスにおける扁桃体の変性
(A−C)ヘマトキシリンエオシンによる染色、スケール1mm、(D−F)スケール250μm (G−I)TUNNEL法によるアポトーシスの検出 スケール1 mm
ホモマウスでは扁桃体(*)に限局して神経細胞の密度が低下(CおよびF)
アポトーシスをおこした細胞数がホモマウスで増加(I矢印)

図12 ナトリウムポンプalpha 2サブユニット遺伝子欠損マウスにおける恐怖.不安行動の昂進
明暗ボックス(A−D)高架十字迷路(E−G)条件付け恐怖におけるフリ−ズ(H)
呼吸運動が全く観察されないことの原因を探るために、脳幹脊髄ブロック標本を野生型とalpha 2遺伝子欠損マウスから調製し、光学測定により神経活動をモニターした(図13)。野生型ではリズムジェネレーターの領域に抑制的神経活動が見られるのに対し、alpha 2遺伝子欠損マウスにおいては興奮生の神経活動が見られた。この原因は神経細胞内でのClイオン濃度の上昇によるものであり、alpha 2サブユニットと神経細胞でのClイオン輸送体であるKCC2との機能共役が示唆された。

図13 赤はパターン形成ニュロン群による神経活動。青はリズム形成ニューロン群による神経活動。
ヘテロマウスは明期における過食を示し、そのために肥満となる。過食の原因は不明であるが、恐怖不安行動が亢進していることから、ストレスを多く感じるためである可能性も考えられる。

図14 左はへテロマウス、右は野生型マウス。
◎代表的な発表論文(括弧内はGoogle Scholarによる被引用回数)
1. "Primary structure of the alpha-subunit of Torpedo californica (Na+ K+)-ATPase deduced from cDNA sequence." Nature 316:733-736 (1985) Kawakami, K., Noguchi, S., Noda, M., Takahashi, H., Ohta, T., Kawamura, M., Nojima, H., Nagano, K., Hirose, T., Inayama, S., Hayashida, H., Miyata, T. and Numa, S.
2. "Molecular cloning and sequence analysis of human Na,K-ATPase beta-subunit." Nucl. Acids Res. 14:2833-2844 (1986) Kawakami, K., Nojima, H., Ohta, T. and Nagano, K.
3. "Primary structure of the alpha-subunit of human Na,K-ATPase deduced from cDNA sequence." J. Biochem. 100:389-397 (1986) Kawakami, K., Ohta, T., Nojima, H. and Nagano, K.
4. "The transmembrane segment of human Na,K-ATPase beta-subunit acts as the membrane insertion signal." J. Biochem. 103, 54-60 (1988) Kawakami, K. and Nagano, K.
5. "Identification and purification of a human immunoglobulin enhancer binding protein (NF-kB) that activates transcription from a human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) promoter in vitro." Proc. Natl. Acad. Sci. 85:4700-4704 (1988) Kawakami, K., Scheidereit, C. and Roeder, R. G.(89)
6. "Location of signal sequences for membrane insertion of the Na+,K+-ATPase alpha subunit." Molec. Cell. Biol. 9:5742-5745 (1989) Homareda, H., Kawakami, K., Nagano, K. and Matsui H.(8)
7. "Regulation of Na+,K+-ATPases I. Cloning and analysis of the 5'-flanking region of the rat NKAA2 gene encoding alpha 2 subunit." Gene 91:267-270 (1990) Kawakami, K., Yagawa, Y. and Nagano, K.
8. "Regulation of Na+,K+-ATPases II. Cloning and analysis of the 5'-flanking region of the rat NKAB2 gene encoding beta 2 subunit." Gene 91:271-274 (1990) Kawakami, K., Okamoto, H., Yagawa, Y. and Nagano, K.
9. "Cloning and analysis of 5'-flanking region of rat Na+/K+-ATPase alpha 1 subunit gene." Biochim. Biophys. Acta 1049:286-292 (1990) Yagawa, Y., Kawakami, K. and Nagano, K. (17)
10. "Identification and characterization of the cis-elements regulating the rat AMOG (Adhesion Molecule on Glia)/Na,K-ATPase beta 2 subunit gene." J. Biochem. 111:515-522 (1992) Kawakami, K., Suzuki-Yagawa, Y., Watanabe, Y. and Nagano, K. (7)
11. "Housekeeping Na,K-ATPase alpha 1 subunit gene promoter is composed of multiple cis-elements to which common and cell type specific factors bind." Molec. Cell. Biol. 12:4046-4055 (1992) Suzuki-Yagawa, Y., Kawakami, K. and Nagano, K. (29)
12. "Sp1 binds to the Adhesion Molecule on Glia regulatory element that functions as a positive transcription regulatory element in astrocytes." J. Neurosci. Res. 35:138-146 (1993) Kawakami, K., Watanabe, Y., Araki, M. and Nagano, K. (3)
13. "Anomalous interaction of Sp1 and specific binding of an E-box-binding protein with the regulatory elements of the Na,K-ATPase alpha 2 subunit gene promoter." Eur. J. Biochem. 218:195-204 (1993) Ikeda, K., Nagano, K. and Kawakami, K. (13)
14. "Possible implications of Sp1-induced bending of DNA on synergistic activation of transcription." Gene 136:341-343 (1993) Ikeda, K., Nagano, K. and Kawakami, K. (12)
15. "Transcription factors positively and negatively regulating the Na,K-ATPase alpha 1 subunit gene." J. Biochem. 114:849-855 (1993) Watanabe, Y., Kawakami, K., Hirayama, Y. and Nagano, K. (37)
16. "Different factors bind to the regulatory region of Na+,K+-ATPase alpha 1-subunit gene in cell cycle." FEBS Lett. 335:251-254 (1993) Kawakami, K., Yanagisawa, K., Watanabe, Y., Tominaga, S. and Nagano, K. (9)
17. "ATF-1/CREB heterodimer is involved in constitutive expression of the housekeeping Na,K-ATPase alpha 1 subunit gene." Nucl. Acids Res. 23, 2848-2855 (1995) Kobayashi, M. and Kawakami, K. (18)
18. "DNA binding through distinct domains of zinc-finger-homeodomain protein AREB6 has different effects on gene transcription." Eur. J. Biochem. 233, 73-82 (1995) Ikeda, K. and Kawakami, K. (38)
19. "Structure, function and expression of a murine homeobox protein AREC3, a homologue of Drosophila sine oculis gene product, and implication in development." Nucl. Acids Res. 24, 303-310 (1996) Kawakami, K., Ohto, H., Ikeda, K., and Roeder R. G. (54)
20. "Characterization of the core promoter of the Na+/K+-ATPase alpha 1 subunit gene: Elements required for transcription by RNA polymerase II and III in vitro." Eur. J. Biochem. 237, 440-446 (1996) Kawakami, K., Masuda, K., Nagano, K., Ohkuma, Y. and Roeder, R. G. (6)
21. "Cis-elements involved in differential expression of Na,K-ATPase alpha 2 subunit gene in muscle differentiation." Biochim. Biophys. Acta. 1308, 67-73 (1996) Ikeda, K. and Kawakami, K. (3)
22. "Identification and expression of six family genes in mouse retina" FEBS Lett. 393, 259-263 (1996) Kawakami, K., Ohto, H., Takizawa, T. and Saito, T. (71)
23. "Phosphorylation of ATF-1 enhances its DNA binding and transcription of the Na,K-ATPase alpha 1 subunit gene promoter." Nucl. Acids Res. 25, 877-882 (1997) Kobayashi, M., Shimomura, A., Hagiwara, M. and Kawakami, K. (7)
24. "Promoter of the Na,K-ATPase alpha 3 subunit gene is composed of cis-elements to which NF-Y and Sp1/Sp3 bind in cardiac myocyte." Biochim. Biophys. Acta. 1352, 311-324 (1997) Murakami, Y., Ikeda, U., Shimada, K. and Kawakami, K. (22)
25. "Synergism of the ATF/CRE site and GC box in the housekeeping Na,K-ATPase alpha 1 subunit gene is essential for constitutive expression." Biochem. Biophys. Res. Comm. 241, 169-174 (1997) Kobayashi, M. and Kawakami, K. (10)
26. "Involvement of negative co-factor NC2 in active repression by zinc-finger-homeodomain transcription factor AREB6." Molec. Cell. Biol. 18, 10-18 (1998) Ikeda, K., Halle, J-P., Stzeler, G., Meisterernst, M. and Kawakami, K. (33)
27. "Tissue and developmental distribution of Six family gene products." Int. J. Dev. Biol. 42, 141-148 (1998) Ohto, H., Takizawa, T., Saito, T., Kobayashi, M., Ideda, K. and Kawakami, K. (29)
28. "Overexpression of the forebrain-specific homeobox gene six3 induces rostral forebrain enlargement in zebrafish." Development, 125, 2973-2982 (1998) Kobayashi, M., Toyama, R., Takeda, H., Dawid, I. B. and Kawakami, K. (88)
29. "Promoter of mDMAHP/Six5: differential utilization of multiple transcription initiation sites and positive/negative regulatory elements." Hum. Molec. Genet. 7, 2103-2112 (1998) Murakami, Y., Ohto, H., Ikeda, U., Shimada, K., Momoi, T. and Kawakami, K. (12)
30. "Localization of Six4/AREC3 in the developing retina; implications in mammalian retinal development." Exp. Eye Res., 67, 699-707 (1998) Niiya, A., Ohto, H., Kawakami, K. and Araki, M. (8)
31. "Cooperation of Eya and Six in transactivation of their target genes through nuclear translocation of Eya." Mol. Cell. Biol. 19, 6815-6824 (1999) Ohto, H., Kamada, S., Tago, K., Tominaga, S., Ozaki, H., Sato, S. and Kawakami, K. (96)
32. "Structure and chromosomal mapping of human SIX4 and mouse Six4 genes." Cytogenet. Cell Genet. 87, 108-122 (1999) Ozaki, H., Yamada, K., Kobayashi, M., Asakawa S., Minoshima S., Shimizu N., Kajitani, M., and Kawakami, K. (6)
33. "Six family genes-Structure and Function as transcription factors and their roles in development" BioEssays 22, 616-626 (2000) Kawakami, K., Sato, S., Ozaki, H. and Ikeda, K. (94)
34. "Expression of three zebrafish Six4 genes in the cranial sensory placodes and the developing somites." Mech. Dev. 98, 151-155 (2000) Kobayashi, M., Osanai, H., Kawakami, K. and Yamamoto, M. (25)
35. "Six4, a putative myogenin gene regulator, is not essential for mouse embryonal development." Mol. Cell. Biol. 21, 3343-3350 (2001) Ozaki, H., Watanabe, Y., Takahashi, K., Kitamura, K., Tanaka, A., Urase, K., Momoi, T., Sudo, K., Sakagami, J., Asano, M., Iwakura, Y. and Kawakami, K. (30)
36. "Impaired interactions between mouse Eya1 harboring mutations found in patients with branchio-oto-renal syndrome and Six, Dach and G proteins. " J. Hum. Genet. 47, 107-116 (2002) Ozaki, H., Watanabe, Y., Ikeda, K. and Kawakami, K. (16)
37. "Identification of transcriptional targets for Six5: Implication for the pathogenesis of myotonic dystrophy type 1." Hum. Mol. Genet. 11, 1045-1058 (2002) Sato, S., Nakamura, M., Cho, D. H., Tapscott, S. J., Ozaki, H. and Kawakami, K. (12)
38. "Molecular interaction and synergistic activation of a promoter by Six, Eya and Dach proteins mediated through CBP." Mol. Cell. Biol. 22, 6759-6766 (2002) Ikeda, K., Watanabe, Y., Ohto, H. and Kawakami, K. (30)
39. "Degeneration of the amygdala/piriform cortex and enhanced fear/anxiety behaviors in sodium pump alpha 2 subunit (Atp1a2) defective mice." J. Neurosci. 23, 4667-4676. (2003) Ikeda, K., Onaka, T., Yamakado, M., Nakai, J., Ishikawa, T., Taketo, M. M. and Kawakami, K. (25)
40. "Six1 controls patterning of the mouse otic vesicle.." Development 131, 551-562. (2004) Ozaki, H., Nakamura, K., Funahashi, J, Ikeda, K., Yamada, G., Tokano, H., Okamura, H., Kitamura, K., Muto, S., Kotaki, H., Sudo, K., Horai, R., Iwakura, Y. and Kawakami, K. (37)
41. "Malfunction of respiratory related neuronal activity in Na+, K+-ATPase alpha 2 subunit-deficient mice is due to abnormal Cl- homeostasis in brainstem neurons." J. Neurosci., 24, 10693-10701. (2004) Ikeda, K., Onimaru, H., Yamada, J., Inoue, K., Ueno, S., Onaka, T., Toyoda, H., Arata, A., Ishikawa, T., Taketo, M. M., Fukuda, A. and Kawakami, K. (8)
42. "Slc12a2 is a direct target of two closely related homeobox proteins, Six1 and Six4." FEBS J. 272, 3026-3041. (2005) Ando, Z., Sato, S., Ikeda, K. and Kawakami, K. (1)
43. "Hyperphagia and obesity in Na,K-ATPase alpha 2 Subunit defective mice." Obesity Res. 13, 1661-1671. (2005) Kawakami K., Onaka T., Iwase M., Homma, I. and Ikeda K. (1)
44. "Six1 and Six4 promote survival of sensory neurons during early trigeminal gangliogenesis." Brain Res. 1116, 93-102. (2006) Konishi, Y., Ikeda, K., Iwakura, Y. and Kawakami, K. (1)
45. "Six1 is essential for early neruogenesis in the development of olfactory epithelium." Dev. Biol. 311, 53-68. (2007) Ikeda, K., Ookawara, S., Sato, S., Ando, Z., Kageyema, R. and Kawakami, K.
46. "Defective interaction between dual oscillators for respiratory rhythm generation in Na+, K+-ATPase alpha 2 subunit-deficient mice." J. Physiol. 584, 271-84 (2007) Onimaru, H., Ikeda, K., and Kawakami, K.
47. "Differential expression of Eya1 and Eya2 during chick early embryonic development." Gene Exp. Patterns, 8, 357-367. (2008) Ishihara, T., Ikeda, K., Sato, S., Yajima, H., and Kawakami, K.
48. "Multiple Evolutionarily Conserved Enhancers Control Expression of Eya1." Dev. Dyn. 237, 3142-3156. (2008) Ishihara, T., Sato, S., Ikeda, K., Yajima, H., and Kawakami, K.
49. "CO2 sensitive preinspiratory neurons of the parafacial respiratory group express Phox2b in the neonatal rat. " J. Neurosci. 28, 12845-12850. (2008) Onimaru, H., Ikeda, K., and Kawakami, K.
50. "Phox2b, RTN/pFRG neurons and respiratory rythmogenesis." Resp. Physiol. Neurobiol., 168, 13-18. (2009) Onimaru, H. Ikeda, K., and Kawakami, K.
51. "Regulatory role of Six1 in the development of taste papillae. " Cell Tissue Res. 339, 513-25. (2010) Suzuki, Y., Ikeda, K., and Kawakami, K. .
52. "Six1 is indispensable for production of functional progenitor cells during olfactory epithelial development. " Int. J. Dev. Biol. 54, 1453-1464. (2010) Ikeda. K., Kageyama, R., and Kawakami, K.
53. "Expression of Six1 and Six4 in mouse taste buds." J. Mol. Histol. 41, 205-214. (2010) Suzuki, Y., Ikeda, K, and Kawakami, K.
54. "Conserved expression of mouse Six1 in the pre-placodal region (PPR) and identification of an enhancer for the rostral PPR." Dev. Biol. 344, 158-171. (2010) Sato, S., Ikeda, K., Shioi, G., Ochi, H, Ogino, H. Yajima, H., and Kawakami, K.
55. "Six family genes control the proliferation and differentiation of muscle satellite cells." Exp. Cell Res. 316, 2932-2944. (2010) Yajima, H., Motohashi, N., Sato, S., Ikeda, K., Masuda, S., Yada, E., Suzuki, Y., Takeda, S. and Kawakami, K.
56. "Menthol inhibits respiratory rhythm in the brainstem preparation of newborn rats." Neuro Rep. 21. 1095-1099. (2010) Tani, M., Onimaru, H., Ikeda, K., Kawakam, K., Homma, I,
57. "Phox2b expressing neurons in the most rostral medulla of newborn rats." Adv Exp Med Biol. 669, 87-90. (2010) Onimaru, H, Ikeda, K, Kawakami, K.