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自治医科大学さいたま医療センター・消化器科は首都圏の一角をなすさいたま市の基幹病院の一つとして、消化管、肝臓、胆道および膵臓疾患をはじめとした消化器疾患全般にわたる診断・治療を、消化器科専属の医師と総合診療科の医師が協力して行っています。良質かつ効率的な医療の実践による地域への貢献を目的として病診連携を模索する一方で、地域の医療従事者および患者のみなさま・住民の消化器疾患に対する認識を深める啓蒙活動の一環として、他の医療機関と連携しつつ、研究会・市民教育講演会などを開催してきています。また、全国規模の治験にも参加し、医療の向上に努めていおり、日本消化器病学会・日本肝臓学会・日本消化器内視鏡学会の指導施設であります。
内視鏡分野に関しては、外科と協力して診療しており、最新の設備をそろえ、地域の中核病院として上部・下部消化管、胆・膵系疾患全ての分野において最先端の内視鏡医療を提供しています。近隣の医療施設から数多く紹介されてくる早期胃癌、早期大腸癌症例の治療方針に関しては、毎週、消化器・一般外科と共同で内視鏡カンファランスを行い、内視鏡的に治療すべきか外科的に治療すべきか検討しています。
自治医科大学さいたま医療センター設立の大きな目的の一つは総合医の育成であります、消化器科においても医局員は各々の研究、専門分野を持つと同時に、消化器疾患全般に関する知識を持ち、消化管疾患、胆・膵疾患、肝疾患の全てに対応できるよう、また内視鏡検査においても助手以下の全員が上部、下部のルーチン内視鏡検査に参加するのはいうまでもなく、内視鏡治療、ERCP、EUS等も一通りこなせる様、消化器内科に関する総合医の育成を目標としています。