無菌治療部は、高度な無菌管理が必要な患者であればどの診療科も利用できる中央施設部部門です。

無菌病棟は、クラス100清浄度の病室4床とクラス10,000清浄度の病室4床の計8床からなっています。規定外の観察床1床を有しています。
診療報酬で無菌加算を算定できる造血幹細胞移植を行っています。対象疾患は、急性骨性白血病、急性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、悪性リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、再生不良性貧血。
無菌治療部は、血液科、輸血・細胞移植部、小児科の医師から構成されています。毎週月曜日の午後、医師と看護師の両者が会合し移植カンファを行い、入院中の移植患者の治療方針や看護方針を決定しています。

エビデンスに基づく造血幹細胞移植を行っています。医師と看護師が一体となりチーム医療を行い、その内容を医学書(医師と看護師のための造血幹細胞移植、写真参照)として発表しており好評を得ています。