当センターは１日人間ドック（総合健診）の専門施設として、附属病院とは独立した建物（自治医科大学一号館）にあり、ゆとりあるス ペースと落ち着いた雰囲気の中で健診を受けていただくことができます。健診内容は、日本人間ドック学会、日本総合健診医学会の推奨内容に準拠しており、日本総合健診医学会の「優良総合健診施設」および「人間ドック健診専門医研修施設」にそれぞれ認定されています。

健診の基本コースには、労働安全衛生法による定期健診の必要項目およびがん検診に関する項目を含んでいます。さらに、平成20年度から開始された特定健康診査（特定健診=メタボ健診）の項目も全て含んでおり、その結果に応じて行われる特定保健指導にも完全に対応し、健診当日の初回指導も可能な体制となっています。