2017年から新専門医制度が開始され、以下の19の基本領域が設定されており、自治医科大学では全ての領域において専門研修プログラムを準備しております。
専門医制度では以下の様に基本領域とサブスペシャルティ領域の二段階制度となり、初期研修修了後に基本領域の専門医を取得、その後サブスペシャルティの専門医を取得する仕組みになっています。
基本領域専門医
初期研修後3〜5年間（期間は領域により異なる）の後期研修の後に取得します。
各領域のホームページ一覧はこちらです。
プログラムがご覧いただけます。
※（at）は @ に置き換えてください。
| 基本領域名 | 連絡先 |
|---|---|
| 内科 | 山本博徳 naika-gi(at)jichi.ac.jp |
| 皮膚科 | 小宮根真弓 mkomine12(at)jichi.ac.jp 皮膚科医局 dermat(at)jichi.ac.jp |
| 外科 | 消化器一般・小児・移植 遠藤和洋 kendo(at)jichi.ac.jp 心臓血管・呼吸器 医局 tcv3514(at)jichi.ac.jp |
| 産婦人科 | 高橋詳史 ytakahashi(at)jichi.ac.jp 産婦人科医局 jichi-obgyn(at)jichi.ac.jp |
| 耳鼻咽喉科 | 伊藤真人 makoto-ito(at)jichi.ac.jp |
| 脳神経外科 | 大谷啓介（医局長）m01011ko(at)jichi.ac.jp |
| 麻酔科 | 関厚一郎（医局長）seki.koichiro@jichi.ac.jp |
| 小児科 | 田村大輔 dtamura(at)jichi.ac.jp |
| 精神科 | 須田史朗 sudash(at)jichi.ac.jp 精神科医局 psychiat(at)jichi.ac.jp |
| 整形外科 | 西村貴裕 t.nishimura(at)jichi.ac.jp
整形外科医局 otpdcst(at)jichi.ac.jp |
| 眼科 | 蕪城俊克 kabutosi(at)jichi.ac.jp 又は 眼科医局 ophthal(at)jichi.ac.jp |
| 泌尿器科 | 泌尿器科医局 urology(at)jichi.ac.jp |
| 放射線科 | 放射線医学講座医局 jichi-radiology(at)jichi.ac.jp |
| 救急科 | 救急医学医局 eccm(at)jichi.ac.jp |
| リハビリテーション科 | 井上泰一 hi-kazu(at)jichi.ac.jp |
| 形成外科 | 素輪善弘 sowa(at)jichi.ac.jp |
| 病理 | 福嶋敬宜 nfukushima(at)jichi.ac.jp 又は 河田浩敏 kawata(at)jichi.ac.jp |
| 臨床検査 | 山田俊幸 yamadanji(at)jichi.ac.jp |
| 総合診療 | 畠山修司 chiikikenshuu(at)jichi.ac.jp （地域医療後期研修プログラム連絡用アドレス） |