自治医科大学医学研究科は、独創性の高い先端医学から臨床応用を目指して研究しています。また、先端医学を地域医学に展開する多彩な研究システムがあります。様々な分野で、世界の最先端の研究が行われています。
自治医科大学看護学研究科では、看護学の高度な専門知識、技術を有し、看護管理と実践的教育、研究を通じて地域のケアニーズに即した看護活動を改革できる高度専門職業人としての上級看護職者を養成しています。